
В 1995 году закончила Казахский государственный университет им. Аль-Фараби по специальности «История» и получила квалификацию - историк, преподаватель истории и обществоведения (специализация – История Казахстана). С 1999 г. по 2002 г. обучалась в Карагандинском государственном техническом университете по специальности «Экономика (в социальной сфере и отраслях), закончила с квалификацией экономист-юрист. В 2002 г. поступила в аспирантуру ВКГУ им. С. Аманжолова на специальность 07.00.02 «Отечественная история», которую закончила досрочно – выходом на защиту диссертации. В 2004 году успешно защитила диссертацию на соискание ученой степени кандидата исторических наук на тему «Воспроизводство населения Казахстана (1979-1999 гг.)».
С 1995 г. по 2006 г. проработала в Восточном гуманитарном институте: преподаватель, доцент ВГИ, с сентября 2005 года – заведующая кафедрой «Юриспруденция» Восточного гуманитарного института. С сентября 2006 года работает на кафедре история Казахстана и право в качестве старшего преподавателя, с октября 2007 г. - доцент ВКГТУ им.Д.Серикбаева, является председателем учебно-методической комиссии факультета «Экономика и менеджмент».
Ж.С. Аубакирова является одним из постоянных организаторов в проведении международных научных конференций «Этнодемографические процессы в Казахстане и сопредельных территориях», участником региональных, республиканских и международных научно-практических, научно-теоретических конференций, состоявшихся в гг. Барнаул, Алматы, Уральск, Усть-Каменогорск, Семее, Петропавловске. В период работы над диссертацией сотрудничала с кафедрой исторической информатики и архивоведения Алтайского государственного университета (г. Барнаул), где была успешно освоена методика кластерного анализа.
Ж.С. Аубакирова является старшим научным сотрудником Лаборатории Демографии и научно-исследовательской лаборатории «Демографические процессы населения Большого Алтая» ВКГТУ им. Д. Серикбаева.
Обладатель международного гранта "Национальные историографии в постсоветской Центральной Азии" (2007-2010 гг.), участник Региональных Семинаров по улучшению качества Преподавания (Regional Seminars for excellence in Teaching, ReSET) Института Открытого Общества Центрально-Азиатского Ресурсного Центра (г. Будапешт). В рамках данного проекта приняла участие в 7 международных семинарах в г.Алматы, г. Бишкек, Иссык-куль (сертификаты).
Автор более 40 научных статьей и учебно-методических публикаций. Сфера научных интересов: историческая демография Казахстана, история Казахстана.